Können während der Kurzarbeit Über- oder Minusstunden entstehen?

Nein, die Kurzarbeit darf kein Einfluss auf das Zeitkonto haben.

Die "Minusstunden" sind sozusagen die Ausfallzeit / Kurzarbeit.

Wenn Plusstunden vorliegen, dann hätte für den Mitarbeiter keine Kurzarbeit beantragt werden dürfen.